일반적으로 질환을 치료하는 방법에는 크게 다음과 같이 세가지로 분류된다. 이종요법이란 환자의 병의 증상과 비슷하지 않는 전혀 다른 방법을 사용하여 병의 원인을 없애거나 제거하는 치료 방법이다. 현대 서양의학의 항생제, 항염제, 항고혈압제, 항암제, 항당뇨제, 항부정맥제등 "항" 이 동반되는 대부분의 약품들이 사용되는 치료들이 이에 속한다. 역종요법이란 환자의 병의 증상과 전혀 반대가 되는 방법을 사용하여 병을 치료하는 것으로 현대 서양의학의 변비 시에는 설사약을 주고 설사 시에는 변비를 일으킬 수 있는 약을 주는 것이다. 동종요법이란 환자의 병의 증상과 비슷한 증상을 유발시키는 방법이다. 즉 동종요법의 치료의 원칙은 유사(類似)법칙이다. 그리스말로 "Similia similibus curentur" 즉 Like cures likes 이다.현대 서양의학의 치료방법은 환자가 겪고있는 증상 또는 원인을 억제하거나 또는 증상과 반대되는 작용을 유발시킴으로써 치료하는 이종(異種) 또는 역종(逆種) 요법이지만 동종요법에 의한 치료는 전통의학에 의한 치료방법과 정반대이다.즉 환자가 어떠한 증상을 겪고 있으면 증상을 억제하거나 증상과 반대되는 작용을 유발시킴으로써 치료하는 것 (서양전통의학의 치료법)이 아니라, 오히려 환자의 병적상태와 비슷한 증상을 유발 시킬 수 있는 동종요법 약품을 찾아 환자가 이를 복용케 함으로써 환자가 가지고 있는 자가면역능력을 깨우쳐 줌으로써 스스로 치유하도록 하는것이다. 바꾸어 말하면 현대 서양 전통의학의 피료방법은 대부분 증상을 억누르거나 (suppression) 또는 부족한 것을 보충(sustitution) 하는 방법이라면 동종요법에 의한 치료는 환자의 병적상태와 유사한 증상을 유발시킬 수 있는 자연약품을 찾아 환자로 하여금 복용케 함으로써 환자의 신진대사를 조정해주는 것이라 할수 있다. 현대 전통의학은 대부분 환자의 고통을 비자연적인 화학약품을 사용하여 치료하는 비자연적, 타동적 그리고 일시적으로 억제하는 치료 방법이 대부분이다. 그리하여 전통의학에서 사용하는 약품은 항 고혈압제, 항 부정맥, 항암제 등 질병을 근원적으로 치료하는 것이 아니라 일시적으로 억제(항)하는 역할을 한다. 현대 전통의학의 치료 방법이 대 부분 증상을 억누르거나(suppression) 또는 부족 한 것을 보충(substitution)에 의한 방법이라면 동종요법에 의한 치료는 식물이나 광물로 된 자연 약품을 사용하여 인간 원래의 신진대사를 조정해 줌으로서 환자의 자연 치유능력을 유발시켜 스스로 치유 되게끔 함으로 자연적 치료라고 하겠다.또한 동종요법 치료는 전통의학과는 달리 같은 질환일 찌라도 같은 약품으로 치료하지 않는 점이다. 세계의 사람은 하나도 같은 사람이 없듯이, 같은 질환일 찌라도 질환의 특성, 환자의 체질, 특성, 성격 등을 중시하여 환자마다 다른 종류의 약을 사용하여 치료한다. 예를 들어 같은 기관지 천식 환자라 할 지라도 사용되는 약은 Ipecacuanha, Cupurum, Kalium Bichromicum 등 수 십 종이 넘는 여러 가지 약이 있어 환자마다 다르게 치료한다. 다시 설명하면 동종요법은 현대 전통의학과 같이 환자의 신체에 나타난 부분적 증상만을 중시하여 치료하는 것이 아니라, 환자의 전체를 고려 하여, 고통이 되는 부분적 증상 뿐만이 아니라 환자의 고통과는 직접적인 관련이 없는 환자의 과거력, 체질, 개인적 특성, 정신, 사회적 환경까지도 고려한 후 치료 약을 선택하게 되는 환자 맞춤 치료라 하겠다. 또 다른점은 동종요법의 한 가지 약품은 한 가지 질환의 치료에만 사용되는 것이 아니라 여러 가지 질환에 대하여 계통적으로 동시에 작용한다. 즉 미나리야 제비 과에 속하는 Pulsatilla 이라는 동종요법 약품은 중이염에 대단히 효과적인 약이지만 그 외에도 기침, 기관지 천식, 복통, 설사 또는 요도염 등 광범위하게 여러 가지 질환에 대하여 계통적으로 동시에 작용한다. 그러므로 한 환자가 여러 질환을 호소한다 할 찌라도 질환별로 약을 주는 것이 아니라 환자에게 적합한 한 종류의 동종요법 약품을 선택하게 된다. 동종요법 치료의 또 다른점은 동종요법 치료에서 사용되고 있는 약품들은 서양의학의 화학적 약품과는 달리 부작용이 없다는 점이다. 동종요법이 전통의학 치료와 다른 점을 요약하면 다음과 같다. 동종요법 전통의학 자연 치유 능력 화학적 능동적 타동적 근원적 일시적 개별적 획일적 전인적 부분적 그러나 동종요법 치료가 서양의학과 치료를 달리 한다 할 찌라도 동종요법을 전통의학을 부정하거나 전통의학을 대체(代替)하는 치료 방법으로 오해 되어서는 않된다. 동종요법 의사들은 의과대학에서 현대 전통의학을 전공한 전문 의료인이다. 동종요법 치료에서는 환자의 진단과 치료가 전문 의료인에 의하여 이루어 지고 있다. 환자의 진단도 원시적 또는 민속적이 아니라 현대 전통의학의 발전된 진단 방법을 이용하여 진단한다. 치료에서도 일반적으로 동종요법 약품만으로 환자의 질환을 치료 하지만 필요에 따라서 일부 질환에서는 현대 전통의학의 약품을 동시에 같이 사용한다. 암 질환이나 심한 감염성 질환 등이 그 대표적인 것이라 하겠다. 이러한 점에서 동종요법 치료는 국내에서 흔히 대체의학이라는 이름 하에 행해지는 비 과학적이고 비 윤리적인 치료와는 전혀 다르다. 결론적으로 동종요법 치료가 다른 점이 많이 있기는 하나, 전통의학을 대체하는 것이 아니라 전통의학의 한계점이 있는 많은 만성 질환 치료에서 현대 전통의학을 보완하는 역할을 하는 현존하는 최고의 보완ㆍ대체의학이라 하겠다.